משכנתא דרגה שניה הינה משכנתא נוספת אשר ניתנת על דירה עליה יש משכנתא בדרגת ביטחון גבוהה יותר (משכנתא בדרגה ראשונה). משכנתא דרגה שניה נחשבת לנחותה ביחס למשכנתא מדרגה ראשונה והמשמעות היא כי במקרה בו הלווה אינו עומד בהחזר החובות, הרי שמימוש הנכס מתבצע בהתאם לסדר הקדימויות – קודם לבנק אשר משכן את הנכס בדרגה ראשונה ולאחר מכן לממשכן מדרגה שניה.
משכנתא דרגה שניה ניתנת על ידי הבנקים או גופי מימון כאשר הם סבורים כי קיימת בטוחה מספקת להחזר ההלוואה וזאת לאחר כיסוי החוב מדרגה ראשונה.